A Neuropeptid Y (sertés) CAS-száma 83589-17-7; molekulaképlete C190H287N55O57, molekulatömege megközelítőleg 4253,70. Az Y neuropeptid (ember/patkány) CAS-száma 90880-35-6, molekulaképlete C189H285N55O57S, molekulatömege megközelítőleg 4271,68; tárolása általában -20 fokos hűtést igényel. Az NPY egyedülálló hajtűszerű konformációval rendelkezik, amelyet "hasnyálmirigy-polipeptid" redőnek neveznek.
Az Y neuropeptid széles körben elterjedt a központi idegrendszerben; koncentrációja a legmagasabb a hippocampusban, ezt követi az agykéreg, a hipotalamusz, a talamusz, az agytörzs és a kisagy. A hipotalamusz íves magja az NPY szintézis elsődleges helye. Az NPY-expresszáló neuronok specifikus populációi a dorsalis raphe magban és az agytörzs ventrolateralis periaqueductalis szürke részében találhatók. A perifériás idegrendszerben az NPY elsősorban a noradrenalinnal lokalizálódik a szimpatikus idegekben, és a szimpatikus idegvégződésekből szabadul fel. A kardiovaszkuláris rendszer bőséges NPY idegrostokat tartalmaz, az NPY széles körben elterjedt a szív és az erek körül.
